PPGBM

GEP 0003 – Evolução
Caráter: Eletiva
Créditos: 04
Nº de horas: 60 horas
Professores responsáveis: Drs. Aldo Mellender de Araújo, Karen Luisa Haag, Helga Winge e Thales R. Ochotorena de Freitas
Será ministrada somente em 2011.

Súmula:
A diversidade biológica no planeta Terra e sua interpretação. As evidências e as explicações evolutivas. O contexto ecológico da mudança evolutiva. Conceito de população. Lei de Hardy e Weinberg. Forças evolutivas. Variabilidade genética em populações naturais. Raciação: estrutura genética das raças. Conceito(s) de espécie. Mecanismos de isolamento reprodutivo. Especiação.

Bibliografia:
GRANT, V. The evolutionary process. A critical study of evolutionary theory. 2 nd.ed. New York, Columbia University Press, 1991
FUTUYMA, D.G. Biologia Evolutiva. 2a. Ed. Ribeirão Preto, Sociedade Brasielira de Genética/CNP. 1992.
KING, M. Species evolution. The role of chromosome change. Cambridge, Cambridge University Press, 1993.
SPIESS, E.B. Genes in populations, 2nd ed. New York, Willey, 1989.

Observação: Além da bibliografia básica citada, são distribuídos com antecedência artigos atuais relevantes.

GEP 00007 - Seminários
Caráter: Obrigatório
Nº de créditos: 01
Carga Horária: 15 h
Profa. Responsável: Dra. Lavinia Schüler-Faccini

Súmula:
Discussão de tópicos de interesse para a Genética, organizada sob a forma de ciclo de seminários.

GEP 00009 - Genética de Populações
Caráter: Eletiva
Nº de créditos: 03
Carga Horária: 45 h
Prof. Responsável: Dr. Aldo Mellender de Araújo

Súmula:
Cruzamentos aleatórios e a cinética do equilíbrio para dois locos com dois ou mais alelos. Cruzamentos não aleatórios: efeitos populacionais do endocruzamento para sistemas unilocos, com dois ou mais alelos. Populações de tamanho finito: deriva genética. Tamanho efetivo de populações. Efeito fundador e suas conseqüências para a especiação. Populações subdivididas. Estrutura hierárquica de populações. Metapopulações. Fluxo gênico e distância genética. Seleção natural: modelos para ambientes estáveis. Topografias adaptativas. Teorema fundamental da seleção natural. Modelos para ambientes heterogêneos no espaço e no tempo. Mutação e a teoria da neutralidade (mutação neutra - deriva genética).

Bibliografia:
Hartl, D.L. & A.G. Clark. 1989. Principles of Population Genetics. 2nd. Ed. Sinauer Associates, 682 p.
Spiess, E.B. 1989. Genes in populations. 12nd. Ed. Wiley Interscince. 774 p.

Observação: Além da bibliografia básica, são distribuídas previamente aos alunos cópias de artigos científicos recentes sobre o tema.

GEP 00010 - Genética Estatística
Caráter: Eletivo
Nº de créditos: 03
Carga horária: 45 h
Prof. responsável: Dra. Sídia Maria Callegari-Jacques

Súmula:
Distribuição binomial, proporções. Testes de hipóteses para duas amostras com variáveis quantitativas e qualitativas. Correlação e regressão linear simples. Análise da variância a um e dois critérios de classificação. Testes não-paramétricos. Análise de tabelas de contigência. Regressão múltipla. Análise de componentes principais

Bibliografia: (Atual 2010)
CALLEGARI-JACQUES, S.M. & WAGNER, E. M. Análise estatística de dados biológicos (ex-Notas de aula de Bioestatística. Manuscrito, março 2000)
DANIEL, W.W. Applied Nonparametric Statistics. Boston, Houghton-Mifflin, 1978.
EVERITT, B.S. The analysis of contingency tables, 2 ed. London, Chapman & Hall, 1992.
JOHNSON, R.A., WICHERN, D.W. Aplied multivariate statistical analysis. 3 ed. Englewood Cliffs, NJ, Prentice-Hall, 1992.
LEVIN, J. Estatística aplicada às Ciências Humanas. São Paulo, HARBRA, 1978.
MANLY, B.F.J. Multivariate Statistical Methods: a primer London, Chapman & Hall, 1986
PRA, L.E. Análisis Multivariado: Método de components principales, Washington-DC, OEA, Programa Regional de Desarollo Cientifico y Tecnologico, 1986.
SIEGEL, S. Nonparametric Styatistics for the Behavioral Sciences. New York, McGraw-Hill, 1966.
SOARES, J.F. FARIAS, A.A. & CESAR, C.C. Introdução à estatística. Rio de Janeiro, Livros Técnicos e Científicos Ed. 1991
VIEIRA, S. Introdução à bioestatística. Rio de Janeiro, Campus, 1981
WONNACOTT, T.H., WONNACOTT, R.J. Introdução à Estatística. Rio de Janeiro. Livros Técnicos e Científicos S. A.m 1977
ZAR, J.H. Biostatistical Analysis 4ed. Upper Saddle River, New Jersey, Prentice-Hall, 1999.

GEP 00013 - Evolução Molecular
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos:03
Carga horária: 45 h
Profa. Responsável: Dra. Karen Luisa Haag

Súmula:
A disciplina visa dar ao aluno uma visão geral sobre os processos envolvidos na evolução do genoma, das proteínas e da função catalítica.

Bibliografia:
Bibliografia atualizada (artigos científicos), distribuída previamente aos alunos.

GEP 00015 - Tópicos em Genética Avançada I (MESTRADO)
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 01
Carga horária: 15 h
Responsáveis: Professores do PPGBM

Súmula:
Tópicos escolhidos de acordo com as necessidades avaliadas pelo professor orientador no candidato, de maneira a atualizá-lo em campos não abordados por qualquer das disciplinas do Programa. Cada tópico é avaliado outorgando-se um crédito ao aluno após julgamento de uma monografia com, no mínimo, 20 páginas digitadas em espaço duplo, sintetizando vários artigos especializados.

Bibliografia:
Artigos especializados

GEP 00026 - Evolução Humana
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 02
Carga horária: 30 h
Prof. Responsável: Dr. Francisco M. Salzano

Súmula:
Esta disciplina visa a fornecer aos alunos uma visão sobre os problemas, a metodologia e os principais resultados obtidos em aspectos específicos da evolução humana. Inicialmente, para colocá-la em perspectiva, são revisados aspectos da evolução do universo e dos seres vivos em geral. No que se refere à evolução biológica da espécie humana propriamente dita, consideram-se: (a) evolução molecular; (b) o sistema genético; c) estrutura populacional; e (d) antropogênese. Após, abordam-se a evolução da cultura (origem e difusão, diversidade e adaptação); e, finalmente, as populações brasileiras.

Bibliografia:
Para cada sessão de discussão fornece-se, sempre, cópia de artigos publicados nos últimos dois anos para discussão e interpretação.

GEP 00028 - Genética do Desenvolvimento
Caráter: Eletivo
Nº de créditos: 03
Carga horária: 45 h
Profa. Responsável: Dra. Vera Lúcia da Silva Valente Gaiesky

Súmula:
Regulação da função gênica em células normais e neoplásicas de eucariotes. O papel dos hormônios na diferenciação. Moléculas célula-adesivas. Expressão de genes maternos e embrionários durante o desenvolvimento inicial. Determinação genética e transdeterminação. Genes homeóticos e especificação da identidade segmental. Transformação genética com transposons, Genética da Senescência e morte celular. Regulação gênica na evolução adaptativa.

Bibliografia:
Discussão de artigos científicos atuais sobre o tema.

GEP 00029 – Seminários
Caráter: Obrigatório
Nº de créditos: 01
Carga Horária: 15 h
Profa. Responsável: Dra. Lavinia Schüler-Faccini

Súmula:
Discussão de tópicos de interesse para a Genética, organizada sob a forma de ciclo de seminários.

GEP 00034 – Seminários
Caráter: Eletivo
Nº de créditos: 01
Carga Horária: 15 h
Profa. Responsável: Dra. Lavinia Schüler-Faccini

Súmula:
Discussão de tópicos de interesse para a Genética, organizada sob a forma de ciclo de seminários.

GEP 00036 - Tópicos em Genética Avançada II (DOUTORADO)
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 01
Carga horária: 15 h
Responsáveis: Professores do PPGBM

Súmula:
Tópicos escolhidos de acordo com as necessidades avaliadas pelo professor orientador no candidato, de maneira a atualizá-lo em campos não abordados por qualquer das disciplinas do Programa. Cada tópico é avaliado outorgando-se um crédito ao aluno após julgamento de uma monografia com, no mínimo, 20 páginas digitadas em espaço duplo, sintetizando vários artigos especializados.

Bibliografia:
Artigos especializados e atualizados.

GEP 00038 - Genética Humana Molecular
Caráter: eletivo
Nº de créditos: 03
Carga horária: 45 h
Profs. Responsáveis: Drs. Claiton Bau e Ida Vanessa D. Schwartz
Profa. convidada: Dra. Patrícia Ashton-Prolla

Súmula:
Organização do material genético do homem. A estrutura dos genes humanos. Famílias de genes como unidade funcional do genoma humano. O genoma mitocondrial. Estimativas do tamanho do genoma humano. Variação genética ao nível do DNA. O mapeamento do genoma humano. Construção de mapas genéticos e físicos dos cromossomos humanos. Herança multifatorial e identificação de genes candidatos. Patologia molecular das doenças monogênicas. Relação entre fenótipo e genótipo. Padrões não clássicos de herança. Genética e Câncer. Tratamento de doenças genéticas.

Bibliografia para consulta:
Artigos selecionados indicados no início da disciplina.
Strachan, T. & Read, A P. Human Molecular Genetics 3. New York: Garland Science, 2004.

GEP 00055 - Adaptações Genéticas: Origem e Evolução
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 03
Carga horária:45 h
Prof. Responsável: Dr. Aldo Mellender de Araújo

Súmula:
Esta disciplina tem por objetivo discutir de maneira aprofundada algumas adaptações largamente distribuídas entre os animais, particularmente em insetos (embora os vegetais não estejam excluídos totalmente). Serão tratados temas como padrões de coloração e o quanto estes incluem-se em sistemas dinâmicos como o mimetismo, aposematismo e camuflagem. Todos estes aspectos relacionam-se à seleção natural, sendo um dos tópicos da disciplina justamente a medida da seleção tanto na natureza como em experimentos. O papel da reprodução sexuada será enfatizado na discussão de temas como a proporção sexual a adaptações que envolvem a seleção sexual. O comportamento animal será analisado tendo em vista a evolução de fenótipos (altruísmo, agressividade, etc.) e sua interpretação por intermédio da teoria dos jogos e modelos de seleção natural mais abrangentes.

Bibliografia:
Bibliografia especializada e atual (artigos cientpificos) distribuída aos alunos com antecedência.

GEP 00067 - Evolução: Epistemologia e História
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 02
Carga horária: 30 h
Prof. Responsável: Dr. Aldo Mellender de Araújo

Súmula:
A disciplina visa oferecer aos alunos uma formação básica tanto em aspectos filosóficos das teorias evolutivas, bem como históricos, seguida da discussão de trabalhos publicados na literatura contemporânea. A disciplina também pretende que os alunos possam seguir o curso dos questionamentos filosóficos sobre as ciências , a partir do Positivismo Lógico (Círculo de Viena), passando pelas visões de ciência de Kuhn, Lakatos e Feyerabend (visões extermalista e anarquista, de um modo especial), bem como a escola francesa de Bacharelardo (rupturas epistemológicas).

Bibliografia:
BOWLER, P.J. 1989 – Evolution. The history of na Idea. Univ. of California Press, 432 páginas
BRANDON, R.N. 1996 – Cocepts and methods in evolutionary biology Cambridge Univ. Press, 221 páginas
FOTHERGILL, P.G. 1952 – Historical aspectos of organic evolution. Hollis and Carter. 427 páginas.
HULL, D. 1975 – Filosofia da Ciência Biológica. Zahar Editores, 198 páginas
LLOYD, E.A., 1988 – The structure and confirmation of evolutionary theory. Greewood Press, 235 páginas
MAYR, M. 1982 – The Growth of Biological throught. The Belknap Press 974 páginas.
RUSE, M. 1974 – The philosophy of Biology. Hutchinson Univ. Ilibrary 231 páginas.
SMOCOVITIS, V. 1996 – Unifying Biology – The evolutionary sysnthesis and evolutionary biology. Princeton Univ. Press. 230 páginas.
SOBER, E. 1993 – The nature of selection. Evolutionary theory in philosophical focus. The Univ. of Chicago Press, 383 páginas.
SOBER, E. 1993 – Philosophy of biology. Westview Press. 231 páginas
SOBER, E. 1994 – From a biological point of view. Cambridge Univ. Press 235 páginas

Observação: Discussão de artigos científicos atuais.

GEP 00068 - Genética Médica
Caráter: Eletivo
Nº de créditos: 03
Carga horária: 45 h
Profas. Responsáveis: Dras. Lavínia Schüler Faccini e Patrícia Ashton-Prolla

Súmula:
Freqüências, classificação e impacto das doenças genéticas. Malformações congênitas. Anomalias cromossômicas numéricas e estruturais e suas conseqüências clínicas. Erros inatos do metabolismo. Aspectos genéticos e distúrbios da diferenciação sexual. Infertilidade e abortamentos de repetição. Retardo mental. Genética do câncer. Triagem de heterozigotos. Triagem neonatal. Tratamento das doenças genéticas. Diagnóstico pré-natal. Aconselhamento genético. Aspectos éticos e legais.

Bibliografia:
RIMOIN, D.L.; CONNOR, J.M. & PYERITZ, R.E. (eds). Principles and parctive of medical genatics (3rd ed). Ed, Churchill Livingstone, New York, 2937 pp 1996.
CASTILLA, E.E., LOPEZ-CAMELO, J.S., PAZ. J.E. & ORIOLI, I.M. Prevención primaria de los defectos congénitos. Editora FIOCRUZ, Rio de Janeiro, 147 pp., 1996.
HARPER, P.S. Practical genetic couselling (3rd ed). Wrigth London, 305 pp, 1988
STRACHAN, T. & READ, A.P. Human Molecular Genetics. New York: Bio Scientific Publichers, 1996.

GEP 00069 - Prática de Ensino em Genética
Caráter: Obrigatório
Nº de créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Prof. Responsável: Orientador do aluno de Pós-Graduação

Súmula:
Possibilita a prática supervisionada de alunos do Programa de Pós-Graduação com o ensino de uma das disciplinas oferecidas pelo Departamento de Genética aos diferentes Cursos de Graduação. A disciplina poderá ser relacionada com a sua área de interesse e/ou trabalho de dissertação ou tese. Cabe ao aluno apresentar um planejamento da atividade que vai desenvolver, bem como preparar e ministrar aulas. A participação do aluno em sala de aula não deverá ultrapassar 20 horas. O aluno é acompanhado pelo professor regente e pelo orientador, nas diferentes atividades ao longo do semestre, recebendo um conceito ao final do seu treinamento.

GEP 00070 - Prática Avançada de Ensino em Genética
Caráter: Obrigatória para alunos de doutorado
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Prof. Responsável: Orientador do aluno de Pós-Graduação
Pré-requisito: Prática de Ensino em Genética (GEP 00069)

Súmula:
Possibilita a prática supervisionada de alunos do Programa de Pós-Graduação com o ensino de uma das disciplinas oferecidas pelo Departamento de Genética aos diferentes Cursos de Graduação. A disciplina poderá ser relacionada com a sua área de interesse e/ou trabalho de dissertação ou tese. Cabe ao aluno apresentar um planejamento de atividade que vai desenvolver. preparar e ministrar aulas, bem como avaliar os graduandos. A participação do aluno em sala de aula não deverá ultrapassar 20 horas. O aluno é acompanhado pelo professor regente e pelo orientador, nas diferentes atividades ao longo do semestre, recebendo um conceito ao final do seu treinamento.

GEP 00072 - Cultura de Tecidos e Transformação Genética de Plantas
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 03
Carga horária: 45 h
Profas. Responsáveis: Dras. Maria Helena Bodanese Zanettini e Eliane Kaltchuk dos Santos

Súmula:
Cultura de Tecidos: Hormônios e reguladores do crescimento no controle da morfogênese. Organogênese e embriogênese somática. Micropropagação. Conservação de germoplasma in vitro. Variação somaclonal. Cultura de embriões zigóticos imaturos. Cultura de anteras. Isolamento e fusão de protoplastos. Aplicações no melhoramento.
Transformação genética de plantas: Clonagem de genes. Métodos de transformação. Aplicações no melhoramento. Análise de risco e biossegurança.

Bibliografia:
BIRCH, R.G. Plant transformation: problems and strategies for practical application. Annu. Rev. Plant. Physiol. Plant Mo. Biol., vv.48, p.397-326, 1997.
CAVAN, G.; BISS, P.; MOSS, S.R. Herbicide resistande and gene flow in wild-oats (Avena fátua and Avena sterilis ssp. Ludoviana). Ann. Appl. Biol., v. 133, p. 207-217. 1998.
DODEMAN, V.L.; DUCREUX, G.; KREIS, M. Zugotic embryogenesis versus somatic embryogenesis. Journal Experimental Botany, v. 48, p. 1493-1509. 1997.
FOSKET, D.E. Piant growth and development. A molecular approach. Academic Press, Inc. San Diego, 580 p. 1994.
HENRY, Y. Origin of iácrospore-derived dlhaploid and polyhaploid itz vitro plants. Plant Tissue Culture and Biotechonology, v.4, p. 127-135. 1998.
KATHEN, A. The debate on risks from plant biotechnology: the end of reductionism? Plant Tissue Culture and Biotechnology, v. 4, p. 136-147. 1998.
JAIN, s.m. & De KLERK, G-J. Somaclonal variation in breeding and propagation of ornamental crops Plant Tissue Culture and Biotechnolog, v.4, p.63-75. 1998.
SIEMENS, J. & SCHIEDERO. Transgenic plants. – genetic transformation – recent developments and the state of the art. Plant Tissue Culture and Biotechnology, v. 2, p. 66-75, 1996.

GEP 00075 – Bases biológicas do comportamento humano: darwinismo aplicado ao comportamento.
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 01
Carga Horária: 15 h
Prof. Responsável: Dr. Renato Zamora Flores

Súmula:
Algoritmos darwinianos, teoria e aplicações biológicas, psicológicas e sociais. Evolução da cooperação: o modelo do dilema do prisioneiro. Teoria da seleção de grupos neurais (darwinismo neural). Memética. Noções de processamento biológico e mental da informação.

Bibliografia:
Dennet, D.C. A perigosa idéia de Darwin. Rio de Janeiro: Rocco, 1998.
Sober, E. Philosophy of Biology. Bolder: Westview, 1993.
Daly, M. Evolutionary adaptatinism: another biological approach to criminal and antisocial behaviour. In: Bock, G.R. & Gonde, J.A. (eds). Genetics of criminal and antisocial behaviour. Chichester: John Wiley & Sons, 1996, p. 183-191.
Ridley, M. As origins da virtude – um estudo biológico da solidariedade. Rio de Janeiro: Record, 2000.
Sober, E. & Wilson, D.L. Unto other – the evolution and psychology of unselfish behavior. Cambridge: Harvard Univ. Press, 1998.
Edelman, G.M. Biologia da consciência. Lisboa, Inst. Piaget, 1995.
Edelman, G.M. & Tomoni, G. A universe of consciousness. New York: Basic Books, 2000.
Kandel, E.R. Biology and the future of psychoanalysis: a new intellectual framework for psychiatry revisited. American J. Psychiatry, 156(4): 505-524, 1999.

GEP 00076 – Genética do Desenvolvimento Humano.
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 03
Carga Horária: 45 h
Profas. Responsáveis: Dras. Lavínia Schüler-Faccini e Kátia Kvitko

Súmula:
Genes relacionados ao desenvolvimento humano. Interação genes e ambiente no desenvolvimento desde o período embrio-fetal até a vida adulta. Neuroteratogênese. Mecanismos responsáveis pela gênese de aberrações cromossômicas. Mutações dinâmicas e suas conseqüências clínicas, incluindo aspectos de aconselhamento genético. Genética dos distúrbios psiquiátricos mais freqüentes. Medicina fetal. Doenças neuromusculares degenerativas e esqueléticas. Retardo mental. Apectos éticos específicos no aconselhamento genético, na pesquisa e em terapia gênica.

Bibliografia:
Gilbert, Connor JM & Pyeritz, R.E. (eds) Principles and practice of medical genetics (3rd ed). Ed. Churchill Livingstone, New York, 2937 pp. 1997
Harper PS. Practical genetic counseling (4th ed). Wright. London, 305 pp., 1999.
Strachan, T. & Read, A. P. Human Molecular Genetics. 2a ed New York: Bio Scientifica Publishers, 1999
Vogel F & Motulsky A.G. Genética Humana. Ed. Guanabara Koogan, Rio de Janeiro, 684., 2000
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/

Artigos selecionados de periódicos especializados relacionados a cada tópico. Estes artigos serão atualizados a cada ano.

GEP 00077 – Tópicos em Genética Vegetal
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 03
Carga Horária: 45 h
Profas. Responsáveis: Dras. Loreta Brandão de Freitas, Eliane Kaltchuk dos Santos e Fernanda Bered

Súmula:
Modos de reprodução e variabilidade genética; Desenvolvimento vegetal; Alterações cromossômicas; Domesticação de plantas; Filogenia de plantas; Melhoramento genético e genética vegetal.

Bibliografia:
São indicados artigos científicos de periódicos especializados.

GEP 00082 – Imunogenética Molecular
Caráter: Eletiva
Nº de Créditos: 03
Carga Horária: 45 h
Prof. Responsável: Dr. José Artur Bogo Chies

Súmula:
Mecanismos de estabelecimento, seleção e manutenção dos repertórios de células B e T de organismos sadios. Mecanismos envolvidos no rearranjo de receptores (imunoglobulinas e receptores de células T) do sistema imune. Citocinas, quimiocina e seu envolvimento na regulação do sistema imune. Mecanismos responsáveis pela quebra do equilíbrio no sistema imune. Desenvolvimento de doenças de fundo autoimune e/ou proliferativo.

Bibliografia:
ABRAS, A.K.; LICHTMAN, A.H.; POBER, J.S. Cellular and Molecular Immunology, fifth edition. W.B. Sauders ed. (2003).
LEWIN, B. Genes VII. Oxford University Press. (2000).
ROITT, I., BROSTOFF, J. MALE, D. Immunology, 6 th edition. Mosby-Year Book Inc. (2001).

GEP 00078 - Aconselhamento Genético
Caráter: Eletiva
Nº de Créditos: 02
Carga horária: 30 h
Profa. Responsável: Dra. Patrícia Ashton-Prolla
Pré-requisito:GEP 00068 - Genética Médica

Súmula:
A disciplina “Aconselhamento Genético” aborda, através de aulas teóricas e seminários teórico-práticos, a teoria e aplicações práticas do aconselhamento genético na prática clínica diária. Os alunos são expostos a temas introdutórios sobre estrutura, etapas e estratégias de aconselhamento genético e posteriormente participam de sessões práticas de aconselhamento em suas diferentes aplicações.

Bibliografia:
Emery AEH and Mueller RF. Elements of Medical Genetics. Churchill Livingstone, 8th ed, 1992
Harper OS. Practical Genetic Counselling. Oxford University Press, 5th ed 1998
Vogel F and Motulsky AG. Human Genetics. Problems and Approaches. Springer, 3rd ed. 1997
Weil J. Psychosocial genetic counseling. Oxford University Press, 1 st ed, 2000

GEP 00080 – Genética e Conservação
Caráter: Eletiva
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Prof. Responsável: Dr. Thales Renato Ochotorena de Freitas

Súmula:
Marcadores moleculares; estrutura populacional; genética e conservação; genética e conservação em espécies vegetais; genética e conservação em espécies de vertebrados; hibridação entre espécies; fragmentação de habitat.

Bibliografia:
AVISE, J.C. & HAMRICK, J.L. 1996. Conversation Genetics? Cases histories from natur. Chapman & Hall Press, 512p.
AVISE, J.C. 2000. Phylogreography? The history and formation of species. Harvard College, 446p.
AVISE, J.C. 1994. Molecular markers, Natural History and Evolution, Chapman & Hall Press. 510 p
BAKER, A.J. 2000. Molecular methods in ecology? Methods in ecology. Blackwell Science, 337p.
GOLDESTEIN, D.B. & SCHLÖTTERER, C. 1999. Microssatellites? Evolution and Applications. Oxford University Press, 352p.
HILLIS, D.M. MORITZ, C. & MABLE, B.K., 1996. Molecular systemacs. Sinauer Associates, Inc. Publishers.
NEI, M. & KUMAR, S. 2000. Molecular evolution and philogenetics. Oxford University Press, 333p.
REAL, L.A. 1994. Ecological Genetics. Princenton University Press. 238p.

Bibliografia Extra: Textos da Moelcular Ecology e Trends in Ecology and Evolution.

GEP 00084 – Polimorfismos Moleculares de DNA e suas Aplicações em Plantas
Caráter: Eletiva
Nº de Créditos: 03
Carga Horária: 45 h
Profa. Responsável: Dra. Fernanda Bered

Súmula:
1. Análise da diversidade genética através de marcadores moleculares de DNA. 2. Principais técnicas utlizadas para analisar polimorfismos de DNA. 3. Métodos de análise da diversidade genética. 4. Principais aplicações dos polimorfismos de DNA.

Bibliografia:
FERREIRA, M.E. & BRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética, 2ed. EMBRAPA-CENARGEN, 1995. pp. 220
FREITAS, L.B. & BERED, F. Genética e Evolução Vegetal. 1 ed. Editora da UFRGS, 2003, pp.463

GEP 00085 – Genética de Populações e Evolução Molecular de Patógenos
Caráter: Eletiva
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Profa. Responsável: Dra. Karen Luisa Haag

Súmula:
1. Estrutura e dinâmica populacional de parasitos; 2. Evolução e epidemiologia molecular de parasitos; 3. Ferramentas experimentais e estatísticas utilizadas no estudo da interação parasita-hospedeiro.

Bibliografia:
BUSCH, A.O. FERNANDEZ, J.C. ESCH, G.W. e SEEDM, J.R. Parasitism: the diversity and ecology of animal parasites. Cambridge University Press. 2001
GRAUR, D. E LI, W-H. Fundamentals of molecular evolution. Sunderland, Sinauer Associates, 2000
HARTL, D.L. E CLARK, A.G. Principles of populations genetics. Sunderland, Sinauer Associates, 1997.
LEWIN, B. Genes VII. New York, Oxford University Press, 2000
PAGE, R.D.M. e HOLMES, E.C. Molecular Evolution: a phylogenetic approach. Oxford, Blackwell Science, 1998.
THOMPSON, R.C.A. Molecular Epidemiology of Infections Diseases. London, Arnold, 2000.
WEIR, B.S. Genetic Data Analysis. Sunderland, Sinauer Associates, 1990.

GEP 00086 – Tópicos em Genética Molecular e Vegetal
Caráter: Eletivo
Créditos: 01
Carga Horária: 15 h
Profas. Responsáveis: Dras. Luciane Passaglia, Maria Helena Bodanese Zanettini, Eliane Kaltchuk dos Santos e Fernanda Bered

Súmula:
Discussão de tópicos de interesse para a genética molecular e vegetal, organizada sob a forma de ciclo de seminários.

Bibliografia:
Artigos especializados e atualizados

GEP 00087 – Princípios de Biologia Molecular
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 04
Carga Horária: 60 h
Profa. Responsável: Dra. Luciane Passaglia

Súmula:
Estrutura dos ácidos nucléicos e organização gênica em organismos procarióticos e eucarióticos. Replicação de DNA. Transcrição e processamento do RNA de células eucarióticas;Código genético e síntese de proteínas; Regulação da expressão gênica em nível de transcrição; Processos que atuam na geração de variabilidade genética: mutação, reparação do DNA e recombinação genética.

Bibliografia:
ALBERTS, B. et al. Biologia Molecular da Célula 3ª ed. Porto Alegre, Editora Artes Médicas, 1997.
ALBERTS, B. et al. GEP 00087- Princípios de Biologia, Editora Artes Médicas, 1999.
ALBERTS, B. et al. Molecular Biology of the Cell 4th ed. New York, Garland Science Publishing, 2002.
BROW, T.A. genomes 2nd ed. Oxford. BIOS Scientific Publishers Ltda., 2002.
BROWN, T.A. Clonagem Gênica e Análise de DNA, 4ª ed. Porto Alegre, Editora Artes Médicas. 2003.
CAMPBELL, M.K. Bioquímica 3ªed. Porto Alegre, Editora Artes Médicas, 2000.
GIBSON, G. & MUSE, S.V. A primer of genome science. Sunderland, Sinauer Associates, Inc. 2002.
LEWIN, B. Genes VII. Porto Alegre, Editora Artes Médicas, 2001.
LODISH, H. Et al. Molecular Cell Biology 4 th ed. New York, w.h. Freeman and Co, 2000.
MICKLOS, D.A.; FREYER, G.A. & CROTTY, D.A. DNA Science – A First Course. 2rd ed. Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2003.
SAMBROOK, J. % RUSSEL, D.W. Molecular Cloning – A Laboratory Manual 3rd ed. Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor Laboratory Press.2001.
STRACHAN, T. & READ, A.P. Genética Molecular Humana. Porto Alegre, Editpra Artes Médicas, 2002.
VOET, et. Al. Fundamentos de Bioquímica. Porto Alegre, Editora Artes Médicas. 2000.
WOLPERT, L.. et al. Princípios de Biologia do Desenvolvimento. Porto Alegre. Editora Artes Médicas, 2000.
ZAHA, A. et al. Biología Molecular Básica. 3ª ed. Porto Alegre, Editora Mercado Aberto, 2003.

GEP 00088 – Sistemática Filogenética
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Profa. Responsável: Dra. Loreta Brandão de Freitas

Súmula:
1) Conceitos e princípios básicos em sistemática filogenética; 2) Métodos de análise em filogenia molecular. O aluno deverá ser capaz de avaliar criticamente artigos científicos envolvendo: 1) sistemática molecular e filogenia; 2) diferentes métodos de análise filogenética.

Bibliografia Básica:
HILLS, D.M.; MORITZ, C. & MABLE, B.K. Molecular systematics. Sinauer Associates Inc., Sunderland. 1996. 655 p.
NEI, M. & KUMAR, S. Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University, New York. 2000. 333p

Observação: Artigos científicos publicados em periódicos de circulação internacional.

GEP 00089 – Análise Filogeográfica
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Profa. Responsável: Dra. Loreta Brandão de Freitas

Súmula:
1) Conceitos e princípios básicos em filogeografia; 2) Estrutura populacional e variabilidade genética; 3) Genealogia e especiação. Filogeografia – definição, conceitos e histórico; Filogeografia moelcular; teoria da coslescência; Usos e aplicações dos estudos filogeográficos; Filogeografia e identificação de processos de especiação; Filogeografia para estudos de endemismos.

Bibliografia:
AVISE, J.C. Phylogeography: the history and formation of species. Harvard Univ Press, Cambrigne. 2000. 447 p.
BALDING, D.J., BISHOP, M. And CANNINGS, C. (eds). Handbook of statistical genetics. J. Willey and Sons. 2001. 863 p.

GEP 00091 – Genômica Funcional de Plantas
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30 h
Profa. Responsável: Dra. Márcia Margis

Súmula:
Definição de genômica estrutural e genômica funcional. Introdução aos projetos genomas de plantas e utilização dos bancos de dados. Análise de transcriptona: seqüenciamento do genoma funcional, análise de microarranjos, SAGE. Mutagênese insercional: produção de mutantes por inserção de T-DNA, transposons, retrotransposons, “transactivation”. Genética reserva: TILLING, silenciamento gênico, “screening” de bilbiotecas de inserção. Utilização de mutantes dominantes negativos em escala genômica

Bibliografia:
A disciplina é baseada em artigos científicos recentes, como por exemplo:

An et al., (2005) Molecular genetics using T-DNA in rice. Plant Cell Physiol. 45:14-22
International rice genome sequencing project (2005) the map-based sequence of the rice genome. Nature 436:793-800.
Kim et al., (2003) Gene expresión análisis of Arabidopsis chromosome 2 using a genomic DNA amplicon microarray Genome Research 13: 327-340, Chandeler & Werr (2003) When negative is positive in functional genomics. Trends in Plant Science 8:279.
Perry et al., (2003) A TILLING reverse genetic tool and a Web-accessible collection of mutants of the legume Lotus Japonicus. Plant Physiol 131:866-871
Springer (2000) Gene traps: tools for plant development ang genomics. Plant Cell 12: 1007-1020
Upadhyaya et al, (2006) Dissociation (Ds) constructs, mapped Ds launch pads and a transiently-expressed transposase system suitable for localized insertional mutagenesis in rice. Theor. Appl. Genetic.

GEP 00092 – Identificação e clonagem de genes vegetais
Caráter: Eletivo
Nº de Créditos: 02
Carga Horária: 30h
Profa. Responsável: Dra. Márcia Margis

EMENTA:
Isolamento de genes através de homologias estruturais: Isolamento de famílias gênicas, Clonagem de genes através de PCR, Clonagem através de “imunoscreening”. Isolamento de genes através de seu padrão de expressão: “Screening” diferencial, “Diferential trapping”, “cDNA-AFLP”, “SAGE”. Clonagem por funcionalidade: Complementação de mutantes, Proteínas de ligação a DNA. Clonagem utilizando outros organismos: Clonagem por complementação de mutantes em outros organismos, “Two Hybrid System”.

Bibliografia:
A disciplina é baseada em artigos científicos recentes, como por exemplo:

Galpaz N, Ronen G, Khalfa Z, Zamir D, Hirschberg J. A. Chromoplast-Specific Carotenoid Biozynthesis Pathway Is Reveale by Cloning of the Tomato white-flower Locus.
Plant Cell. 2006 Jun 30; (Epub ahead of print)
Hamann T, Lange L. Discovery, cloning and heterologous expression of secreted potato proteins reveal erroneous pre-mRNA splicing in Aspergillus oryzae.
J Biotechnol. 2006 Jun 28; (Epub ahead of print)
Suchankova P, Kubalakova M, Kovarova P, Bartos J, Cihalikova L, Molnar-Lang M, Endo TR, Dolezed J. Dissection of the nuclear genome of barley by chromosome flow sorting.
Theor Appl. Genet. 2006 Aug; 113 (4): 651-9. Epub 2006 Jun 30.
Saha S, Enugutti B, Rajakumari S, Rajasekharan R. Cytosolic Triacylglycerol Biosynthetic Pathway in Oilseeds: Molecular Cloning and Expression of Peanut Cytosolic Diacylglycerol Acyltransferase. Plant Physiol. 2006 Jun23; (Epub ahead of print)

GEP 00093 - Terapias Inovadoras para Doenças Monogênicas
Nº de Créditos: 2
Carga Horária: 30 h
Professora Responsável: Dra. Ida Vanessa D. Schwartz
Pré-requisito obrigatório: para alunos do PPGCM, Disciplina de Genética Médica;
para alunos do PPGBM não há pré-requisitos.

Súmula:
Esta disciplina destina-se a alunos de pós-graduação cujas áreas de atuação se realizem ou na Genética Humana ou na Clínica Médica. O público alvo são alunos de Mestrado e de Doutorado do Curso de Pós-graduação em Medicina: Ciências Médicas da UFRGS, que já tenham cursado a Disciplina de Genética Médica do mesmo Curso; e os alunos de Mestrado e de Doutorado do Curso de Pósgraduação em Genética e Biologia Molecular da UFRGS.
A disciplina pretende analisar as estratégias de tratamento das doenças genéticas, disponíveis ou em desenvolvimento, sob a ótica da genética clínica baseada em evidências.

Referências bibliográficas:
Thompson & Thompson. Genetics in Medicine. W.B.Saunders Company, Philadelphia, 7° ed., 2007.
Pappalardo, E., et al. Increased expression of C1-inhibitor mRNA in patients with hereditary angiodema treated with Danazol. Immunology 2003;86:271-276.
Gelfand. Jeffrey A., et al. Treatment of hereditary angiodema with Danazol. The new England Journal of Medicine 1976;23:1444-1448.
Fabiani, Jose E., et al. Hereditary angiodema: therapeutic effect of danazol on C4 and C1 esterase inhibitors. Annals of Allergy 1990;64:388-392.
Moser, Hugo W.,et al. Follow-up of 89 Asymptomatic patients with Adrenoleukodystrophy treated with Lorenzo’s Oil. Arch. Neurol. 2005;62:1073-1080.
Harmatz, P., et al. Enzyme replacement therapy for Mucopolysaccharidosis VI: A phase 3, randomized, double-blind, placebo-controlled, multinational study of recombinant human N-Acetylgalactosamine 4-Sulfatase (Recombinant Human Arylsulfatase B or Rhasb) and follow-on, open-label extension study. The Journal of Pediatrics 2006;533-539.e6.
Levy, H.L., et al. Efficacy of saproterin dihydrochloride (tetrahydrobiopterin 6RBH4) for reduction of phenylalanine concentration in patients with phenylketonuria: a phase III randomized placebo-controlled study. The Lancet 2007;370(11) 504- 510.
Elstein, D., et al. Oral maintenance clinical trial with miglustat for type I Gaucher disease: switch from or combination with intravenous enzyme replacement. Blood 2007, 110(7):2296-2301.
Sermet-Gaudelus, I., et al. In vitro prediction of stop-codon suppression by intravenous gentamicin in patients with cystic fibrosis: a pilot study. BMC Medicine 2007, 5(5):1-10.
Clancy, J.P., et al. No detectable improvements in Cystic Fibrosis transmenbrane conductance regulator by nasal Aminoglycosides in patients with Cystic Fibrosis with stop mutantions. Am. J. Repir Cell Mol Biol 2007;37:57-66.
Wilschanski, M., et al. Gentamicin-Induced correction of CFTR function in patients with Cystic Fibrosis and CFTR stop mutations. The New England Journal of Medicine 2003;9:1433-1441.
Goss, C.H., et al. Should we stop using intravenous gentamicin in patients with Cystic Fibrosis. Thorax 2008;63:479-480. Escolar, M.L., et al. Transplantation of umbilical-cord blood in babies with Infantile Krabbe’s Disease. The New England Journal of Medicine 2005;19:2069-2081.
Brichta, L., et al. Valproic acid increases the SMN2 protein level: a well-known drug as a potential therapy for spinal muscular atrophy. Human Molecular Genetics 2003;12(19): 2481-2489.
Brichta, L., et al. In vivo activation of SMN in spinal muscular atrophy carriers and patients treated with Valproate. Ann Neurol 2006;59:970-975.
Deutekom, J.C.V., et al. Local dystrophin restoration with antisense oligonucleotide PRO051. The New England Jouranl of Medicine 2007;27: 2677-2686.
Tsirigotis, M., et al. Activation of p38MAPK contributes to expanded polyglutamineinduced cytotoxicity. Plos One 2008;3(5)e2130 : 1-13.
Koutsilieri, E., et al. The therapeutic potential of siRNA in gene therapy of neurodegenerative disorders. J Neural Transm 2007;72:43-49.
Sah, D.W.Y., et al. Therapeutic potential of RNA interference for neurological disorders. Life Sciences 2006;79: 1773-1780.
Kubodera, T., et al. New RNAi strategy for selective suppressionof a miutant allele in polyglutamine disease. Oligonucleotides 2005;15:298-302.
Cavazzana-Calvo, M., et al. Gene therapy of human severe combined immunodeficiency (SCID)-X1 disease. Science 2000;288(28): 669-672.